si tu as des trous apres operation morpho cest qu'il y etait avant nan?
et sinon a methode brutos cest un etiquetage et regarde si tu as des particules inclues les unes dans les autres... si cest le cas supprime la particule inclue et tu lui assigne l'etiquette de la partiule la contenant.
net et sans bavure...
[edit] evite les operations d'ouvertures et de fermetures, ca remplira les trous (apres n iterations avec n lineairement ependant de la surface de ton trou/surface de ton element structurant à sa forme pret toussa...) mais surtout ca lissera tes contours, ce qui n'est peut etre pas souhaitable.