Si tu veux que Windows 10 soit installé seul sur un SSD, et tes données sur un HDD, tu n'as rien à faire de particulier si ce n'est que de débrancher tous tes autres disques avant de procéder à l'installation, afin que le bootloader ne soit pas installé sur un disque tiers comme cela peut arriver. Une fois l'installation terminée, tu pourras rebrancher tes autres disques.
C'est exactement ma configuration.