Normalement si tu ne fais pas de copies d'une partition à l'autre, il y a peu de chances que l'infection soit transmise.
Pour ne plus voir ta partition windows dans l'autre windows, va dans gestion de l'ordinateur dans les outils d'administrations, gestion des disques. Ensuite, clic droit sur la partition à masquer, modifier la lettre de lecteur et les chemins d'accès.
Et la tu vires la lettre de lecteur.
Tu ne le vois plus dans le poste de travail. Mais tu peux toujours lui réaffecter une lettre plus tard.
Je ne sais pas si ça empêche un virus de se propager.