Euh, le "vrai" formatage bas niveau, c'est à dire avec réécriture des pistes ( le disque ne se préoccupe même pas des pistes déjà en place, il en écrit d'autres ) est effectivement recommandé uniquement comme "opération de la dernière chance", car il y a un risque de flinguer le disque.
Ca serait bien qu'on connaisse le modèle de ton disque, en tous cas si tu utilises le "faux" formatage bas niveau de Seagate, aussi appelé "zéro fill", tu ne risques rien : il s'agit comme son nom l'indique d'une remise à zéro de tous les bits, mais en conservant les pistes déjà utilisées.
Par contre, attention à la durée de l'opération... je l'ai fait une seule fois, ça a pris plus de 12 heures pour un 7200.2 de 160Go.