En fait g réussi, mais j'explique pour ceux qui ont eu le même problème.
1 Explication de ce qu'est une adresse secondaire Yahoo (sans utilisation de Thunderbird)
J'ai une adresse Yahoo. J'ai ensuite créé ce que Yahoo appelle des adresses secondaires -> ce ne sont pas d'autres comptes Yahoo, ce sont des "sous-comptes" dont les messages peuvent arriver dans la boite de reception ou être redirigé dans un dossier. Ce sont des alias en fait (je vais les appeler comme ça maintenant).
2 Explication de ce que je voulais faire avec thunderbird
Je me suis créé 2 alias, un pour mes abonnements et les newsletter et un pour les mailto de mon site web.
Je voulais que les mails envoyés à ces alias n'arrive pas dans la boite de réception de mon compte yahoo mais dans un autre dossier ("abonnements" et "site web" ).
3 Solution
Comme je l'ai dit, Yahoo peut directement placer les mails des alias dans un dossier différent mais dans ce cas les mails ne sont pas envoyés à thunderbird (ou autre client de messagerie) il faut donc obligatoirement les laisser dans le dossier "boite de réception" de Yahoo.
A cette étape les mails envoyés aux alias sont reçu dans le dossier 'boite de réception' du compte Yahoo sur thunderbird.
J'ai utilisé (ce que je ne connaissais pas avant, sinon je n'aurais pas posé la question) les filtres de thunderbird:
Quand un nouveau message est reçu sur le compte Yahoo, s'il trouve que le destinataire n'est pas l'adresse habituelle de Yahoo mais un alias, le message est redirigé vers un dossier différent de thunderbird
Le filtre utilisé : "Pour ou Cc" "contient" "préfice-alias@yahoo.fr"
Voilà... en tout cas pour moi c'est résolu. Si quelqu'un pense avoir le même problème mais ne comprend rien à mes explication (Je sais je suis pas très clair ) : no pb.