Il n'y a pas de priorité sur les réseaux de Pétri.
Si tu dois absolument, pour une situation donnée, favoriser une transition plutôt qu'une autre, alors les 2 ne doivent pas apparaître au même niveau, tu as un problème de conception.
Par contre, si tu veux faire en sorte que statistiquement une des 2 ai plus de chances que l'autre d'être réalisée, oriente toi vers les réseaux de Pétri probabilistes.
Tu peux aussi explorer du coté des réseaux colorés, mais avant d'aller chercher ailleurs, demande toi si ce n'est pas d'abord un problème de conception.