bah c'est simple :
Windows ne sait lire (et ecrire) que FAT16, FAT32 et NTFS
Il y a des outils pour lire du ext2fs et ext3fs mais pas pour monter de tels disques sous win. Pour information, l'API qui permettrait d'ecrire un pilote de systeme de fichier est tres fermée (le seul bouquin qui soit publié n'est plus edité actuellement, il se negocie d'occasion à 600$), très chère (le SDK vaut 1500$, et le kit complet de dev avec documentation est plus vers les 10000$) et très imbitable (tres tres peu d'outils developpés par d'autres que M$ existent, et franchement c'est pas pour rien...). Pour reecrire un filesysteme windows, il faut qu'il puisse etre compatible avec le gestionnaire de swap, qui est lui meme une vraie merde.
les systemes de fichiers FAT sont documentés et donc portables sur du libre, le systeme NTFS n'est pas documenté.
donc les autres OS peuvent implementer FAT, et essayer d'implementer comme il peuvent NTFS, ca qui fait que on sait le lire, mais l'ecriture est toujours experimentale (si je me souviens bien, actuellement, on sais modifier un fichier, mais pas en creer un nouveau...)
Donc oui, il te reste que la FAT (16 ou 32 suivant la taille de ton disque)
et ca, c'est merci windows...