Ton flashage n'a pas "foiré" car si ça avit été le cas ton pc n'aurait meme pas booté et serait resté en écran noir...
Tu as tout simplement mis à jour ton bios qui a changé certains paramètres et ton windows2000 n'aime pas le changement (car il a été installé avec d'autres paramètres) -> en général c'est les fonctions "ACPI" qui génère ce type de pb.
Soit tu t'amuses à chercher dans ton bios si tu as qque chose de ce gout et tu tentes de le désactiver, soit tu réinstalles ton windows et là ça marchera