Problème résolu: raid activé (je ne sais pas trop pourquoi par contre, pour moi par défaut sur ces bios c'est en "normal" par en "raid).
L'option de boot "embeded Raid DVD/CD rom" correspond du coup au volume raid: par chance, n'ayant pas été configuré, les disques étaient juste attribués au contrôleur, ce qui les rendaient invisibles sur les options de boot, mais pas effacés comme c'est généralement le cas dès qu'il est véritablement actif et configuré.
Tout est donc revenu dans l'ordre.
edit: si le AHCI est grisé, c'est parce que cette option n'est pas possible si le raid est activé
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