Dans les deux cas, que tu prépares ce BTS IG au CNED ou dans un établissement (rythme continue, ou alternance), c'est toujours le même diplome de l'éducation nationnale que tu reçois à la fin.
Ce qu'il faut que tu prennes en compte, c'est "est ce que tu vas arriver à suivre tout seul tes cours ???" Sans prof à tes côtés.... cela ne doit pas être simple... Rien qu'en cours avec un prof, des fois c'est difficile de suivre en comprenant tout, alors chez soi tout seul devant sa feuille....... tu imagines ?! (bon courage)
Si tu as quelqu'un pour t'aider ça serait mieux.
Ensuite, une fois le diplome acquis, je ne vois pas pourquoi les entreprises ne d'embaucherai pas par rapport à un étudiant BTS IG en formation continue.... 
Si tu obtiens le diplôme c'est que tu as beaucoup travailler chez toi pour l'avoir, donc c'est assez valorisant. 
Mais par contre, si deux candidats titulaire du même BTS IG, postule pour la même place, le recruteur valorisera la personne qui à eu son bts en alternance puisqu'il aura + d'expériences professionnelles (ce qui est normale)
Voilà mon avis !
