Normalement si tu as bien configurer tes machines clientes elles n'ont de toutes facon que ton serveur SBS comme serveur DNS, pas les DNS de ton FAI, donc t'as rien a changer.
Sur ton serveur tu n'as normalement qu'a changer les redirecteurs DNS dans ta console DNS : outils d'admin, DNS, clic droit sur ton serveur, propriétés, onglet redirecteur.