Euh...à vérifier. Si tu formates le disque C:, tu cours le risque de shooter des fichiers systèmes de Windows 98 qui s'y trouvent.
Ta partition WinXP est en FAT32 ou en NTFS ? Si elle est en FAT32, efface tous les dossiers (ne touche pas aux fichiers à la racine) qui s'y trouvent depuis WIndows 98 dans faire de format, ce sera tout aussi bien, et plus sûr.