A part Partition Magic, eh bien tu peux essayer Paragon Partition Manager, qui te permettra de virer plus ou moins proprement ta partition linux ext3.
Par contre tu semble oublier quelque chose, c'est que ton bootloader (le truc qui te permet de lancer soit Windows soit Ubuntu - qui normalement doit être Grub) ne va plus se lancer (car la partition Ubuntu sera effacée). Or pour remédier au problème, tu devra lancer une console de récupération avec ton CD Windows et entrer "fixmbr".
Si tu n'a pas de lecteur CDrom, ça risque d'être assez difficile... Si t'arrive à en trouver un, bah utilise plutôt un CD SysRescueCD pour supprimer ta partition ext3, puis insère le CD Windows pour fixer ta mbr.
Cela dit, je te déconseille de laisser Windows sur "un vieil ordi"