Chaque fichier sur ton disque occupe un espace minimum (celui du cluster) quel que soit sa taille reelle. Il faut aussi savoir que la taille du cluster est determiné (pour les partitions FAT) à partir de la taille de la partition. Plus celle-ci est grande, plus le cluster sera grand.
Par exemple, si ta partition a un cluster de 16 octets, si tu crée un fichier texte avec deux lettres, sa taille reelle sera de 2 octets mais sa taille sur le disque sera de 16 octets. En revanche, un fichier de 70 octets occupera 5 clusters de 16 octets et aura donc une taille de 80 octets, même si le dernier cluster n'est pas totalement "rempli".
On pourrait se dire qu'avoir une petite taille de cluster permet d'éviter le gachis d'espace, mais cela entraine aussi la fragmentation des fichiers. Tout est donc dans le compromis.
Pour revenir à ta question, lorsque tu regarde les propriétés de l'ensemble de tes fichiers, tu as la taille réelle et la taille occupée sur le disque. C'est cette derniere qui sert à calculer l'espace libre sur le disque.