Mpcbatchencoder permet de transcoder les fichiers monkey en musepack, mais pas de maintenir les tags (note que Monkey accepte les APE tags pas les IDtags).
Tu seras dans l'obligation de les refaire manuellement (ce qui peut être exécuter en batch, avec mpcbatchencodeur, qui gère le soft « TAG », qui te permet de retrouver les tags à partir du titre très facilement, et de tagger un millier de fichiers au besoin. C'est une solution très rapide (perso, 10 à 15 minutes pour peaufiner une douzaine de disque).