VirtualDubMod (ou VirtualDub) te le permet.
Tu ouvres ta video puis video||filters->null transform et tu positionnes tes X1,Y1,X2,Y2.
Mais cela signifie que tu doives re-encoder (perte de temps et de qualite).
Cf Topic VirtualDub (et p-e la FAQ).
Note que si c'est pour une visu sur ton PC, "mplayerc" te permet de shunter ces bandes noires.