Tu devrais pouvoir faire ça avec MKVMerge, un outil de MKVToolnix.
http://www.bunkus.org/videotools/mkvtoolnix/index.html
MKV Merge, n'est pas vraiment un éditeur vidéo : il est normalement fait pour assembler les pistes audio, vidéo, sous-titres, etc... ensemble dans un fichier mkv mais il possède des options assez avancées pour supprimer une piste audio, d'introduire un délai, etc...
Il possède également une fonction permettant de découper le fichier en plusieurs morceaux indépendants au bout d'un certain temps et ou d'une taille de fichier.
Utilise le délai audio pour faire démarrer ta piste son FR au bon moment et la fonction de découpe pour séparer les 3 premières secondes du reste du film en 2 fichiers séparés. (tu pourras alors te débarrasser du fichier des 3 premières secondes et garder uniquement le fichier contenant le reste du film)
Message édité par BlackShark le 24-02-2011 à 17:02:02