string dans un fichier netcdf

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Auteur	Sujet : string dans un fichier netcdf

Piploum

Bonjour,

Je cherche à écrire en python des données dans un fichier de type NetCDF.
J'ai défini deux variables, l'une de type float, pas de problème, mais l'autre est de type string et je n'arrive pas à la mémoriser dans mon fichier.
J'ai pas mal cherché sur les forums spécialisés mais je n'ai rien trouvé de consistant sur ce point.

Mon bout de code est:

Code :

NVal=cdms2.createVariable( (N.zeros((nvarmax,nlat, nlon)) ),
typecode = cdms2.MV2.float32,
id = "val",
attributes=att_nval)

Code :

NParam=cdms2.createVariable( (OPTIONS["VARS"]),
typecode = 'string',
id = "param",
attributes=att_nparam)

et pour le fichier:

Code :

fout = cdms2.open('NVar.nc','w')
fout.write( NVal )
fout.write( NParam )
fout.close()

et le mesage d'erreur:

Code :

Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
TypeError: write() got an unexpected keyword argument 'type'
>>> fout.write( NParam,'string' )
cdunif: NetCDF: Not a valid data type or _FillValue type mismatch
cdunif: NetCDF: Not a valid data type or _FillValue type mismatch
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/home/share/unix_files/cdat/versions/cdat_install_trunk_x86_64_gcc4_03/lib/python2.5/site-packages/cdms2/dataset.py", line 1459, in write
id=varid, extend=extend, fill_value=fill_value, index=index)
File "/home/share/unix_files/cdat/versions/cdat_install_trunk_x86_64_gcc4_03/lib/python2.5/site-packages/cdms2/dataset.py", line 1391, in createVariableCopy
newvar = self.createVariable(newname, datatype, axislist)
File "/home/share/unix_files/cdat/versions/cdat_install_trunk_x86_64_gcc4_03/lib/python2.5/site-packages/cdms2/dataset.py", line 1179, in createVariable
raise CDMSError, "Creating variable "+name
cdms2.error.CDMSError: Creating variable param

Merci d'avance

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masklinn

í dag viðrar vel til loftárása

Regardes la doc de ton truc cdms2, clairement tu l'utilises mal. Genre tu donnes le typecode cdms2.MV2.float32 pour la première valeur mais la chaîne 'string' pour la seconde, ça te semble pas un poil incohérent?

---------------
Stick a parrot in a Call of Duty lobby, and you're gonna get a racist parrot. — Cody

Piploum

Bonjour, merci pour la réponse, mais... non
L'équivalent en string ou char pour cdms2 ne fonctionne pas. Avec mon astuce, NParam est bien déclarée
De toute façon, comme je l'expliquais, le problème n'était pas là mais dans la dernière commande, pour la mémorisation dans le fichier

fred1599

essaye typecode='c' au lieu de 'string'

Piploum

Bonjour Fred, merci mais avec ta proposition j'ai alors le message d'erreur:

Code :

Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 7, in <module>
File "/home/share/unix_files/cdat/versions/cdat_install_trunk_x86_64_gcc4_03/lib/python2.5/site-packages/cdms2/tvariable.py", line 227, in __new__
order = order)
File "/home/share/unix_files/cdat/versions/cdat_install_trunk_x86_64_gcc4_03/lib/python2.5/site-packages/numpy/ma/core.py", line 2364, in __new__
_data = np.array(data, dtype=dtype, copy=copy, subok=True, ndmin=ndmin)
ValueError: setting an array element with a sequence

Pour info, OPTIONS["VARS"] est un tableau de string: ["a0","a12", "a25", ...]
'string' ou 'S' avec ma ligne de commande fonctionne, NParam est alors bien créée

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Python

string dans un fichier netcdf

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