Salut,
Je suppose que tu as une base sql ou autre. Il te suffit de créer un champ "active", quand tu crées le compte tu le met à "false".
Ensuite dans le mail de confirmation tu fais un liens vers une page qui va faire une requete de mise à jour pour le mettre en "true".
Si je devais le faire je ferai ca. Il existe sans doutes d'autres méthodes