bah le mieux, à mon avis, est :
- partition système win en NTFS, 3 à 5 Go selon ton utilisation
- partitions linux (/, /home, swap, voire plus si affinité)
- partition(s) de stockage, si tu comptes avoir une compatibilité win/linux, il sera préférable de choisir FAT32, mais pour eviter le problème de la défragmentation bien longue et au niveau sécurité des données, il est peut-être préférable de faire des partoches inférieures à 30 Go selon l'espace disque que tu possèdes. tu fais plusieurs partitions de stockage plutôt qu'une grosse qui sera bien énervante quand tu devras la défrag sous win
enfin tout dépend de ton utilisation, mais si tu fais bcp de copies/déplacement/suppressions/gros téléchargements, ce sera plus rapide à gérer...