bizarre... en tant que root tu fais un chmod u+w /etc/lilo.conf. Une question toute bête au cas où, dans la console tu fais bien :
su -
(la tu rentres le mot de passe)
emacs /etc/lilo.conf & (emacs peut etre remplacé par ton editeur favori : vi, nano, kate,kwrite...)
(modification et enregistrement du fichier)
lilo
ttes les commandes doivent etre tapees dans la console ou tu es passé en root.