Pas testé. Mais en gros:
1) il faudra recompiler pour profiter du 64bits (et pas seulement le kernel: gnome, kde, OpenOffice.org, etc.). Je te conseille la gentoo (no troll).
2) seules certaines applications gagneront à être recompilées en 64bits: celles qui manipulent beaucoup de données principalement (disclaimer: c'est très à la louche comme commentaire) donc the Gimp, les applications de cryptage (loop-aes, possiblement ssh), etc.
3) dans tous les cas tu gagnes en performances, même en pur 32bits, grâce au seul cache interne.
Donc je pense que c'est un bon choix; essaie de voir les retours sur les forums gentoo et mandrake ...