Tu peux le faire avec XP jusqu'à une taille de 32Go. Plus, tu n'as pas le choix et WinXP impose NTFS. Décision de M$
MAIS tu peux tout à fait formater une partition de + de 32 Go en FAT32 en utilisant un vieux Windows (98, ME, ...). Soit tu as un double boot, soit tu as un autre PC dans lequel tu formates ton DD, soit tu utilises une disquette de Boot de Win ME sinon Win98 (SE de préférence).
WinME de préférence car le fdisk qui est dessus marche mieux avec les gros DD actuels que celui de Win98.
Si tu n'as pas de disquette de boot (tsss, ça devrait être dans toutes les trousses de secours ça), alors ce site est fait pour toi: http://www.bootdisk.com
vala
EDIT: ou sinon tu fais plusieurs partitions chacune de - de 32 Go, c'est pas une mauvaise idée de partitionner son OS en séparant lecteur système, données, programmes, mémoire virtuelle, ...
Quand un DD est foutu, tu perds tout de toute façon, mais si c'est juste une partition et que tu en as fait plusieurs, bah là tu perds pas tout