J'ai testé ça il y a plus de dix ans sous Windows 98SE, avec une carte AGP + deux cartes PCI. Il suffit de brancher et ça marche. Ensuite activer les écrans, là où sous Windows on choisit la résolution etc.
C'est sûr qu'on peut se poser la question, va-t-il y avoir des conflits entre les cartes, des conflits entre drivers. Le secret, c'est que ça marche sans rien faire de spécial.
Exception, Windows Vista ne supportait pas d'utiliser plusieurs graphiques, sauf si elles étaient assez proches pour utilise le même pilote (pas possible de mélanger une ATI et une nvidia, ou peut-être deux cartes qui ne sont pas de même génération). Mais Win 7 et suivant sont censés supporter des cartes différentes maintenant.
Après voilà il faut des cartes graphiques PCIe 1x, ou une mobo avec plein de ports 16x, ou bien il y a des solutions pour utiliser une carte 16x dans un slot 1x : câble-nappe "riser", ou encore scier le bout de plastique sur le port 1x qui empêche de placer une carte 16x dedans.. attention en informatique c'est complètement con d'attaquer un connecteur avec une lime, une scie ou autre outil (dremel etc.) sauf pour ce cas particulier, et encore il faut se documenter là-dessus et la moindre erreur aura un résultat catastrophique.