Avant le rajout de disque tu veux dire? Ou avant les vérifications que je t'ai proposé?
Le câble sata pour ton second disque était neuf?
Quand tu as tester en débranchant ton disque rajouté, as tu laissé le cable sata connecté?
Tu n'as pas par mégarde bougé celui d'origine, favorisant une mauvaise connection? Voire de la poussière dans la prise, ou HS (compare aussi les prise d'alim pour être sur qu'il n'y ai pas un connecteur suspect, ou testes avec les autres s'il y en a)
Sinon tu dis que le PC gèle parfois ou est lent, donc ça arrive qu'il marche parfaitement?
Dans les rapports Chkdsk, un des disques à a lettre de lecteur "D:", l'autre pour lequel tu as du oublier le "/R" est "\Device\HarddiskVolume1" car il n'y a pas la vérification des clusters dans le rapport. Il faudrait savoir s'il s'agit de la partition contenant windows et lui faire la vérification. Tu peux lancer DISKPART puis taper "list volume".
Ton log du System File Checker est démesuré, peu importe, le but est surtout de le lancer pour qu'il corrige une éventuelle erreur.
Essaye de prendre les données SMART de façon régulière pour qu'on puisse voir l'évolution des valeurs, au cas où je me serais planté sur l'état des disques car quelques valeurs me laissent perplexe. Dans le doute, sauvegarder tes données irremplaçables serait une bonne idée. Un disque qui lâche pile quand tu en rajoutes un serait un coup de malchance, mais à force de redémarrage les données pourraient être endommagées.
Autre vérification à faire dans l'observateur d’évènement, cette fois pas à "Application" mais "Système", les erreurs répertoriées.