pour le raid 0 ( disque système ) vu que tu doit reinstaller windows, tu sera obliger de formater donc ca regle le problème , tu formate les deux disques, tu parametre le nouveau chipset en raid 0 puis install ton OS sur un raid propre et net.
pour les transferts de configurations RAID 1 perso je ne sais pas du tout si ca marche , mais si ca peut marcher tu devrat sans doute bien noter l'ordre des disques pour les remettre exactement dans la meme configuration, et encore si rate, tu sera obligé de formater et donc adieux les données .... donc fait une sauvegarde dans tous les cas.
pour la copie, il existe des logiciels de sauvegarde automatique ( genre ultrabackup et autre ) , mais c'est pas fait pour tout enregistrer en double, ca permet juste de faire une copie d'un certain nombre de dossier sur un autre DD ou sur CD/DVD a intervalle régulier ( tout les soirs par exemple )