Si tu le formate en NTFS tu pourras plus l'utiliser sur un win98 par exemple. C'est pour moi le seul avantage du FAT32...
Sinon ben les 2 sont pas très différents, une histoire de vitesse d'écriture et de lecture, l'un est plus rapide en ecriture, l'autre en lecture (mais c'est minime). Ca se vaut