Salut,
monter des file server ou même des target server sous linux est un de mes passe temps ^^
Alors, déjà, pour les disques green, ils tournent moins vite (5400 ou 5900 rpm chez WD), ça n'influe que très peu sur les débit, mais surtout sur les temps d'accès, bref, pour du file server, osef, ça peut largement suffire.
En ce qui concerne les pannes simultanée, je n'ai encore jamais eu le pb (j'ai une bonne 10aine de grappes raid chez moi, du raid5 de 7200.11, du RAID5 de WD RE3, du raid 0 de SAS de 15000 rpm et quelques RAID1, pas mal de raid de disques qui ont exactement la même usure et de mêmes série. Malgré tout, j'ai remarqué qu'il est fréquent de tomber sur des disques avec des numéros de lots déifférents, même si t'en achète 8 d'un coup, mais bon après c'est la loterie
Pour l'alignement, pas de soucils en raid soft, tes fs seront forcément aligné si tu utilise tes md directement (on n'est ni en fake raid, ni en raid hardware, donc la question de l'alignement n'existe plus : c'est aligné d'office). Par contre, en cas d'utilisation d'une surcouche LVM sur les md, je ne sais pas encore et je suis justement en train d'y regarder cette semaine.
Au pire, sur un raid hardware, c'est plutot simple d'aligner si tu connais le chunk size, au pire, tu laisse le 1er Mo du VD libre (2048 1er secteurs) et tu est sûr à 100% d'être alligné. Outils à utiliser pour s'aligner : fdisk (en mode secteur par secteur : "fdisk -u" ) ou parted (en mode secteur : "parted /dev/sda unit s" ) et baser ses calculs de positionnement de partoches en fonction du chunk size ou d'un multiple du chunk size du VD.
Avec mdadm, je te conseille de créer une bitmap interne sur tes raid (mdadm --grow /dev/mdX -b internal, "-b internal" fonctionne aussi au créate), ça évite le trou d'écriture du raid 5 tout en évitant de se faire chier à tout resync en cas de reboot à l'arache (on ne sait jamais, je sais à quel point c'est long la resync de plusieurs To). En gros, ça crée un raid journalisé, et c'est vraiment très robuste comme système avec un impact nul sur les perf' en usage file server/target server.
Pour la taille, à toi de voir avec ton budget, les disques de 2To ne doivent pas être tellement plus cher que les disques de 1.5To. En revanche, si tu as une sauvegarde à gérer (et il faut toujours avoir un backup quand on centralise ses données), alors il faudra aussi avoir un système de backup assez gros pour le volume de données à sauver.
Perso, maintenant quand j'ai besoin de disques fiables, je monte des WD RE (maintenant les RE4 sont moins cher que les RE3, c'est comme des caviar black mais ils sont bien plus fiables), mais c'est pas tout à fait le même budget, c'est des disque TRES cher pour du SATA de 7200 rpm, mais ils sont aussi très costauds et aussi très performants, et tout adapté pour un usage 24/7. J'en ai 9 comme ça et j'ai un pote qui en a 5
Sinon tu as aussi la solution de mettre plus de disques de 1To et passer en RAID6, mais bon, il faut un boîtier qui suit. Exemple avec ce genre de disque de 1To et tu en mets 6 à 8 en fonction de la capa dont tu as besoin: http://www.ldlc.com/fiche/PB00109952.html
C'est du disque de vidéeosurveillance et je pense que c'est très adapté dans un file server.
Dernièr point à soulever : où héberges-tu l'OS ? Sur un disque à part ou sur le raid soft ?