effectivement le script que l'on renseigne dans l'onglet profil des utilisateur pointe sur netlogon qui est l'equivalent de \\domain\sysvol\domain\scripts\ si je me trompe pas.
utilise les gpo sous AD pour gerer tes script de logon, c bien plus puissant et tu pourras entre autres mettre le chemin que tu veux a ton script.
par contre c un chouillat + complex, faut bien avoir pigé le fonctionnement des gpo AD mais bon c pas sorcier non plus.