Salut,
Je ne connais pas le système de réparation de Win 2003 mais s'il fonctionne comme celui de win XP (depuis le CD d'install) tu te retrouveras sour un shell msdos avec à ta disposition quelques outils pour tenter de réparer ton win.
Entre autres un fixmbr et fixboot (réparer le MBR et le boot.ini)
Et ça ne touche pas aux données contenues sur les partitions.
Gaxx