Un des interêts majeur de NTFS est la sécurité, mais pas uniquement la sécurité d'accès cela concerne aussi la sécurité des données. En effet NTFS est journalisé (comme les BDD) de ce fait en cas de crash du système ou d'applications cela réduit la probabilité de corruption du FS et de perte de données. En outre NTFS offre des fonctionnalités interessantes comme la compression, le cryptage de répertoires ou fichiers (Win2k), les points de montage symboliques ainsi que de petites choses marrantes et peu utilisées comme les alternate streams.