Bon, j'ai bien trouvé les fichiers autoexec.nt et config.nt dans c/windows/repair mais pas command.com
Alors j'ai mis les 2 trouvés dans system 32 avec le command.com de la version familiale que j'ai et là, plus aucun message d'erreur mais l'appli ne se lance pas.
Ensuite j'ai essayé la même chose mais en laissant le commad.com d'origine (qui était présent dans system32 lorsque j'avais mon problème) et là ça MMMMAAAAARCHHHHE !!!
Donc, pour faire clair : J'ai simplement changé les fichiers autoexec.nt et config.nt de system32 par ceux de c/windows/repair
MERCI à tous !
Samburu