Bon, alors évite Linux pour le moment. Soyons clairs, je suis admin système, 90% du parc que je gère tourne sur un Unix-like (Solaris, AIX ou Redhat), et c'est très bien. Mais on n'acquiert pas des compétences correctes d'admin Linux en quelques jours.
Si tu dois bosser tout de suite, autant partir sur des outils que tu maitrises.
Concernant ton souci de Windows, tu fais quoi exactement ? une réinstall sur une nouvelle config ?