Voila, j'avais déja eut le probléme sur un autre PC ( mais je sait vraiment plus comment je l'avais résolu ) :
 
J'ai une carte TV Pinnacle PCTV, et une fois le soft installé, à chaque boot de windows2000, j'ai le repertoire "pinnacle" qui s'ouvre, je peux pas le supprimer, c'est le repertoire des softs de la carte TV.
 
Le rep n'est pas dans démarrage, ni dans win.ini, ni winin.ini.
 
J'ai fait une recherche avec "contenant le texte" pinnacle sur c:, et ça ne m'à rien donné de concluant.    
 
Si jamais quelqu'un d'autre à eut ce probléme...