Tu devrais installer Lilo sur le même disque que Linux et configurer ton bios pour booter sur le disque 2 lorsque tu veux avoir le choix Linux/XP.
Comme ça lorsque tu enlève ton disque 2, tu enlève aussi Lilo et il te suffit de remettre ton boot sur le disque XP dans le bios pour revenir à une config avec XP seul.