Pour les fichiers qui sont dans "Tempory Internet" le mieux est de gérer, je pense, ces fichiers directement avec ton Browser. Mais normalement oui, tu peux les supprimers sans risques.
Pour les fichiers dans "Temp", c'est plus compliqué. Tout dépend si tu y met des fichiers de toi-même ou non ( exemple : si tu fait tes DL dans ce répertoire, c'est à toi de gérer tes fichiers )