ce sont des .bat qu'on lance depuis le pc, ou alors des scripts de connexion ?
dans le premier cas, tu peux utiliser 'autoit', comme ça tu tapes tes commandes batch avec les commandes prévues par autoit, et tu compiles en .exe en 2 clic.
pour le 2ème cas, tu peux utiliser 'kixtart', y a une option qui permet de désactiver la croix de fermeture de fenêtre.