Je suppose que tu veux dire "telecharger FRAGMENTE le disque dur" et non pas "DEFRAGMENTE"
Pour repondre a ta question: je ne vois pas en quoi le lieu de stockage des fichiers telecharges a une importance. Dans les deux cas que tu proposes (disque systeme ou disque de donnees) il te faudra defragmenter regulierement.
Quoiqu'il en soit, meme sur le disque systeme, les fichiers systeme ne seront pas plus fragmente avant qu'apres un telechargement. C'est uniquement l'espace alternativement libre puis occupe, puis a nouveau libre etc... qui se fragmentera, pas l'espace disque occupe en permanence par tes fichiers systeme.
On peut cependant supposer que, tant qu'a faire, il est preferable de faire travailler une autre partition que la partition systeme...