UltraISO permet presque de faire tout ce que tu veux, mais si tu modifie un MDF tu risque aussi de modifier la structure de celui-ci et donc au final, ca ne sert pas à grand chose d'utiliser le format MDF, qui contient entre autre les informations de données sur le CD (erreurs et autre) cela permet de conserver des données pour graver le CD et outre passer une protection en tout cas.
Mais si dans ton cas, c'est une simple image CD à deux balles, autant la convertir en ISO ca prend 15% de place en moins et c'est beaucoup plus souple.