Avisynth est un frameserver (serveur de trames/images), c'est à dire un logiciel qui transforme à la volée les infos d'un fichier dans un format admissible par le logiciel d'encodage. Ici VirtualDub.
Pour cela, dans virtualdub, tu ouvres un fichier *.avs. Ce fichier avs est en realité un fichier texte dans lequel tu donnes les infos telles que fichier source, filtres à appliquer etc.
Par exemple, pour ouvrir un fichier d2v :
http://www.unite-video.com/phpbb/viewtopic.php?t=5035
A propos d'HybridFuPP, c'est une "compilation" de filtres qui permet de rendre la video plus facile à encoder en reduisant sa résolution, en enlevant le bruit etc.
Ceci dit, 2h45 c'est pas mal, si la source est de qualité mediocre, il sera peut-etre difficile d'obtenir un bon résultat.