Cela doit être une erreur de config chez moi alors.
Toutefois, je pense que ton code posséde une erreur:
C:\jdk1.3.1_01\bin\jar -cmf manifest.mf package/*.class
car tu ne nommes pas le fichier crée, je pnse que ton code serait plutot
C:\jdk1.3.1_01\bin\jar -cmf manifest.mf AAA package/*.class