Donc voilà, le site a été transféré et puis rien ne marche (évidemment).  Je regarde l'index.php et puis les premières lignes sont celle-ci:

 
Je ne comprends pas d'ou viennent les valeurs des variables dans le site original en linux/apache, car sur le site en windows/iis les variables sont bien vides donc rien ne fonctionne.  
 
Il y a quelquechose que je n'ai pas compris?

Demande au programmeur, lui seul sait d'où il prends ses valeurs lol
 
Sinon il faudrai voir plus amplement les scripts du site. Peut être que les valeurs sont transmises par $_GET ou $_POST ou autres differents moyen tel l'include que l'on voit.

Je ne connais pas le programmeur qui a fait ce site, ce qui me fait chier un peu c'est vrai.  À priori il n'y pas de variables $_GET ou $_POST vu que c'est la première page quand j'arrive sur le site.
 
En fouillant dans les autres fichiers .php j'ai trouvé les déclarations/affectations de plusieurs des variables d'index.php mais je comprend pas comment le lien peut se faire entres les pages sans include.  

On ne le répétera décidément jamais assez : version récente de php = register_global désactivé par défaut
future versions de php = supression définitive de register_global en cours de prévision (ils en discute mais la décision n'est pas encore prise) pour php6 et supérieur
 
et register_global désactivé = variables de type $var non remplis automatiquement à partir des valeurs contenus dans les $_POST, $_GET, $_SERVER, $_COOKIE ...
 
 
 
Conseil, vérifie le httpd.conf d'apache sous linux afin de voir ce qui est mis dans la variable $debut_standard_fichier. Et si c'est module d'apache qui modifie cette valeur là, ca sera pas simple du tout à trouver. J'espéres pour toi que c'est jsute de l'URL rewrtiting qu'était utilisé pour rajouter cette valeur là.
 
Il y a aussi un fichier qui peut être apellé avant tout autre fichier php à chaque fois qu'une page est demandé, mais je sais plus comment on régle ça dans le php.ini .