Dans mon dossier php4.3.2 j'ai un sous dossier nomé PEAR.
Dedans il y a un fichier nomé go-pear.php
Au vu du contenu, je dirais a première vue que c'est le lanceur de l'installateur.
Si php est installé en module d'apache (sous windows fichier dll), il sufit d'y accédé comme pour n'importe quel fichier php.
Si apache est installé en cgi (sous windows fichier php.exe), tu dois appeller le fichier php.exe en ligne de commande en indiquand que c'est le fichier go-pear.php qui est exéccuté.
Bon, je n'ai jamais essayé de l'installé mais d'après les commentaires et les messages d'erreur au début du fichier, c'est ça que j'ai ccompris. 