J'ai personnellement bien apprécié le couple que tu proposes, on peut changer de lexer à la volée dans JLex (c'est une fonctionnalité sympa). C'était pour un petit compilateur d'un langage fictif (70 classes à tout casser).
Par contre, je n'ai rien évalué d'autre comme outils (ANTLR par ex.).
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trainoo.com, c'est fini