Une solution consiste à faire les développement sur deux bases indépendantes, puis à fusionner les développements.
Le drag 'n' drop marche assez bien avec Access, ce qui fait que la mise à jour de la version principale se fait rapidement en glissant les nouveaux écrans ou requêtes ou modules VBA d'une base vers l'autre.
En plus, cela permet d'avoir une version, dite "complète", qui est habituellement assez propre, et des versions "de développement unitaire" qui contiennent des données de test qu'il est inutile de reporter dans la version "complète".