c'est mal barré. non j'déconne. mais ca risque d'être chiant.
pour booter, si ton CD est bootable, et y a pas l'air, tu peux suivre ca : http://perso.wanadoo.fr/linux_wiza [...] tml#repair
pour (re)créé un boot avec lilo.
Le seul hic c'est que si effectivement après le 1024è secteur, cette version de lilo risque d'être à la peine (maintenant ca ne pose plus de problème en ajoutant un ligne 'lba32' au début de /etc/lilo.conf.
Donc si tu arrive à booter ton système depuis le CD, il te faudra créé une disquette boot. (peut-être faisable directement depuis windows et le CD d'install).
Soit tu t'en satisfait, soit tu mets à jour lilo. (je sais pas à partir de quand la barrière des 1024cyl a été oubliée)
La solution la plus "simple" aurrait été de créé une partition /boot tout au début de ton disque...