Les deux sont très bien, la première est basée sur le chipset haut de gamme X38, et la seconde sur le récent P45.
L'étage d'alimentation de la P5E devrait etre un petit peu meilleur (nb de phases, refroidissement), mais dans la pratique à moins de faire de l'overclock extreme, les deux donneront de bons résultats.
Après, c'est plutot sur le crossfire que la différence peut se jouer : la P5E est en full 2*16 lignes, ce qui est mieux pour cet usage. Mais là ca dépend si tu comptes faire un jour du crossfire avec.