Bah, presque sûr que le HDD n'a rien à voir là-dedans. Vérifie la configuration de l'anti-virus que tu utilises (je suppose que tu en as un...) c'est plus probable que ta lenteur vienne de là. Essaie de le désactiver temporairement pour voir.
Sinon pour la mémoire, si tu veux profiter du dual channel, change tes barettes pour un couple de barettes identiques.
Mais faut pas rêver, pour du traitement de fichier ordinaire, tu ne vas pas avoir une différence de performance extraordinaire entre tes 2 configs.
Comme dit Chandler54, la grosse différence c'est au niveau des jeux que tu l'as (comme tu le constate, d'ailleurs).
J'ai changé récement de config, un peu comme toi, pour passer à une Gigabyte avec athlon 64 3200 en 939 et Leadtek 6800 (avant Asrock+xp 2600+Ati 8500).