Bah, pour les leds tu peux avoir une led "mode veille" par exemple, tu n'es pas obligé de la connecter, le principal c'est que tu aies la led du disque dur et celle qui correspond à la mise sous tension..
Sinon pour les ventilos, le principal c'est que tu branches celui du Proc, les autres c'est accessoire, le ventilo de boîtier tu le branches si ça chauffe trop à ton goût. Si par exemple il y a un ventilo en façade en face des disques durs, c'est intéressant qu'il soit connecté, comme ça, ça participe au refroidissement du(des) disque dur.
Monter soi-même c'est intéressant, mais "c'est en forgeant qu'on devient...etc".
C'est-à-dire que c'est en éprouvant des difficultés et des déboires que tu apprendras.. Surtout fais attention à l'électricité statique ! Touche bien les parties métalliques du boîtier (ou tout autre masse métallique importante) pour te décharger de l'électricité statique, avant de manipuler les cartes et composants électroniques...
La connectique FAN de l'alim est facultative, et tu dois avoir, si ma mémoire est bonne, un ou deux connecteurs qui te permettent de thermo-réguler les ventilos de boîtier (c'est exclusivement réservé à cet effet), c'est-à-dire que ce sont les ventilos que tu branches là-dessus.
Sinon il peut s'agir aussi d'une connectique qui permet de renvoyer le nombre de tours des ventilos d'alim à la carte-mère, ce qui te permettra de lire cette vitesse de rotation sous speedfan, par exemple... Regarde bien la notice du boîtier. Si tu n'es pas sûr, n'utilise pas ces câbles là ! En tout cas il y a peu de chances de se tromper, dans les deux cas les prises sont différentes.
Sinon il y a peu de chance que ça "grille" à l'allumage, positionne avec soin la carte-mère dans le boîtier, le cpu, la barette de mémoire et tout ira bien.