Dans le bios as tu controlé l'ordre dans lequel boot les unités ?
(DD, CDROM , disquette, USB ...)
sinon as-tu un batch qui tente de lire le lecteur de disquette ? dans le repertoire 'user all' et dans ton repertoire 'Menu démmarez'
Il est également possible qu'un virus tente de se propager en tentant de s'installer sur la disquette. Met un disquette vide dans le lecteur avec un exe pour tenter de le pieger, puis depuis un autre PC controle avec un anti-virus si c'est positif tu connaitra alors le nom de l'intrus.
Sinon regarde dans le gestionnaire d'évenement s'il y a une trace d'erreur qui apporterait des infos supplementaire sur le probleme.